Via 'Extra → Back-up van alle instellingen maken...' kunnen alle FreeCommander-instellingen in een andere (reserve)map worden opgeslagen.

Het maken van een back-up van de instellingen is een aanvulling op 'Instellingen opslaan'.

Bij 'Back-up van alle instellingen maken' moet eerst een opslagmap worden geselecteerd. In het keuzevenster 'Bladeren naar map' is de map geselecteerd, die via 'Extra → Instellingen → Algemeen' - 'Back-upmap voor instellingen'  is ingesteld.

Via 'Extra → Alle instellingen terugzetten...'  kunnen alle FreeCommander-instellingen vanuit de reservemap weer worden teruggezet.