Via 'Extra → Alle instellingen terugzetten...' kunnen alle FreeCommander-instellingen uit een extra map weer worden teruggezet.

Daartoe moet eerst de map worden geselecteerd waarin de FreeCommander-instellingen zijn opgeslagen. In het keuzevenster 'Bladeren naar map' is de map gemarkeerd, die via 'Extra → Instellingen → Algemeen' - 'Back-upmap voor instellingen' is ingesteld.