Al activar el punto de menú "Archivo → Copiar con diálogo" o pulsar la tecla "F5" se abre el diálogo de "Copiar".
En el punto de menú "Extras → Configuración → Funciones carpeta/archivo" se puede indicar el modo de copia, existiendo tres opciones para escoger:
Ejemplo de la utilización de dos programas de copia distintos
Como queda dicho se puede establecer "Usar FreeCommander" en "Archivo → Copiar con diálogo " o mediante la tecla "F5".
Para usar el modo de copia de Windows (lo que puede ser necesario si son necesarios derechos de Administrador en el directorio de destino) se puede usar la opción de "Copiar en modo Windows con diálogo":
También se puede copiar sin diálogo a través del punto "Archivo → Copiar" o con la combinación de teclas "Mayús+F5".