General
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En "Extras → Configuración → Mostrar → Árbol de directorios/Favoritos" puede accederse a los siguientes puntos de configuración:

Árbol de directorios
Para mostrarlo puede escogerse una de las alternativas siguientes:
- Un árbol de directorios para ambos paneles
Aparece a la izquierda del panel izquierdo.
- Un árbol de directorios para cada panel
Se muestra uno en cada panel, pudiendo configurarse su posición dentro del panel.
- Posición en el panel
Se pueden seleccionar las siguientes:
- izquierda-izquierda
El árbol de directorios se muestra siempre a la izquierda de la lista de archivos y carpetas.
- izquierda-derecha
Se muestra a la izquierda en el panel izquierdo y a la derecha en el panel derecho.
- derecha - derecha
- El árbol de directorios se muestra siempre a la derecha de la lista de archivos y carpetas.
- derecha - izquierda
Se muestra a la derecha en el panel izquierdo y a la izquierda en el panel derecho..
- Un árbol de directorios para cada panel
Cuando esta opción está seleccionada se puede escoger activar o desactivar el árbol en cada pestaña (desde el punto de menú "Ver → Mostrar el árbol", o la combinación de teclas "Alt+T"). Esto significa que se verá el árbol en unas pestañas y en otras no.
Árbol de directorios - Separador activo visible "hot spot"
Cuando esta opción está seleccionada se mostrará una barra en cada pestaña en que se indicará el desplazamiento del separador, exceptuando el de la ventana principal. La configuración se puede hacer desde "Extras → Configuración → Mostrar" → "Punto activo visible".
Árbol de directorios
- Resaltar mediante el puntero del ratón
Cuando esta opción está seleccionada la línea del árbol de directorios se mostrará resaltada al situarse encima el puntero del ratón.
Árbol de Favoritos
Para mostrar el Árbol de Favoritos puede escogerse una de dos alternativas:
- Un árbol de Favoritos para ambos paneles
Se mostrará a la izquierda del panel izquierdo.
- Un árbol de Favoritos para cada panel
Se mostrarán a la izquierda de cada lista de archivos y carpetas.
Árbol de Favoritos
- Posición junto al árbol de directorios
Cuando aparecen juntos los dos árboles se puede configurar la posición relativa del árbol de Favoritos. Las opciones son:
- A la izquierda del árbol de directorios
- A la derecha del árbol de directorios
- Arriba (encima del árbol de directorios)
- Abajo (debajo del árbol de directorios)