O item do menu principal "Ferramentas" oferece as seguintes funções (itens de menu):

• Salvar configurações
• Backup de todas as configurações...
• Restaurar todas as configurações...
• Personalizar barra de ferramentas...
• Estilo de visualização
• Definir atalhos do teclado...
• Ferramentas favoritas
• Conectar para unidade de rede...
• Desconectar unidade de rede...
• Redirecionar Win+E para o FreeCommander
• Inicialização rápida...
• Executar...
• Caixa do DOS...
• Capturar tela da área de trabalho...